黑玉髓和黑曜石在质地、产地和颜色上有明显的区别。黑玉髓是二氧化硅隐晶质体的统称，内部组成成分呈现为黑色、暗紫色和深黑色，色调均匀，主产在地壳活动频繁的地区。黑曜石是含二氧化硅的非晶质体的宝石。

质地

黑玉髓

玉髓是二氧化硅隐晶质体的统称，是石英的一种，颜色由所含矿物组成成分体现，黑玉髓是颜色呈黑色、暗紫色和深黑色的玉髓，在低温低压时，出现在空洞、热液脉、风化壳、碎屑和温泉沉积物中。黑曜石是自然形成二氧化硅，颜色呈黑色的宝石，它是非晶质体，主要存在于熔岩流外围和火山脚下靠近海的地方。

产地

黑曜石

黑玉髓主产于巴西、乌拉圭、印尼、马达加斯加、台湾等地壳活动频繁地区，黑曜石主产于中美和北美火山活动频繁的地区，如：日本、夏威夷、爪哇岛、冰岛、匈牙利、利帕里群岛、墨西哥、厄瓜多尔和危地马拉以等地，范围较黑玉髓广。

颜色

黑玉髓

黑玉髓的颜色是由内部所含的矿石体现出来的，含铁、锌、钾等化合元素较多时，呈现的是暗黑、暗紫、和深黑色，色调相对均匀，看不到色根色带，在自然光下，呈玻璃和油脂光泽，半透明状较多。黑曜石主要是不透明状，黑色不均匀，断口处锋利，在强光下可以看到眼。